Bioinformatics2026년 3월 1일· 12 min read
논문에 쓸 수 있는 수준의 Figure 만들기 (R/Python)
논문 투고용 Figure를 R과 Python으로 만들면서 겪은 시행착오. 저널 요구사항 맞추기, DPI, 폰트, 색상 선택까지 실전 팁을 정리합니다.
#publication figure#ggplot2#matplotlib#bioinformatics
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총 60개의 글
전체BioinformaticsProteomicsAI/MLCareer생명과학Clinical ResearchComputational BiologySystems Biology바이오인포매틱스구조생물학프로테오믹스멀티오믹스전사체학유전체학네트워크 생물학AI/신약개발합성생물학시스템 생물학마이크로바이옴후성유전체학바이오마커공간 전사체학네트워크 약리학임상 프로테오믹스대사체학
Proteomics2026년 2월 25일· 6 min read
Handling Missing Values in Proteomics: Imputation Methods Compared
Comprehensive guide to missing value imputation in label-free quantitative proteomics. Covers MCAR vs MNAR, MinProb, KNN, BPCA, and minimum/2 methods with R and Python code. Real benchmark results included.
#proteomics#missing values#imputation#MNAR
Proteomics2026년 2월 25일· 9 min read
Differential Expression Analysis in Proteomics: A Complete R Pipeline (limma, t-test, ANOVA)
Step-by-step guide to differential expression analysis in proteomics using R. Covers limma, Welch's t-test, Mann-Whitney, ANOVA with Tukey HSD, BH correction, and volcano plots. With real code and statistical diagnostics.
#proteomics#differential expression#limma#R
Bioinformatics2026년 2월 25일· 10 min read
NGS 데이터 전처리 — FastQC에서 멈추면 안되는 이유
NGS 데이터 전처리에서 FastQC 리포트만 보고 넘어가면 놓치는 것들. 실제 분석에서 겪은 전처리 함정과 해결법을 공유합니다.
#NGS data#FastQC#bioinformatics#preprocessing
AI/ML2026년 2월 23일· 11 min read
AI가 프로테오믹스 리포트를 쓸 수 있을까 — Ollama 환각과의 전쟁
DE 분석 결과를 LLM이 해석하여 리포트를 자동 생성하려 했다. Ollama qwen3:30b의 환각 — 없는 단백질 생성, 수치 날조, 가짜 논문 인용. anti-hallucination 프롬프트와 템플릿 기반 렌더링으로 환각 0%를 달성한 과정.
#LLM#환각#hallucination#Ollama
Bioinformatics2026년 2월 23일· 9 min read
프로테오믹스 분석 플랫폼을 직접 만들어봤다
BioAI Market — 웹 기반 프로테오믹스 분석 플랫폼의 기술적 구현기. QC부터 DE, Pathway 분석까지 파이프라인 설계, ANOVA 벡터화로 215초→5초 최적화, limma 통합, 멀티그룹 UI 구현 경험을 공유한다.
#프로테오믹스#BioAI#limma#ANOVA
Career2026년 2월 22일· 12 min read
바이오인포매틱스 취업, 어떤 스킬이 진짜 필요한가
바이오인포매틱스 분야에서 실제로 취업하고 일하면서 느낀, 진짜 필요한 스킬과 과대평가된 스킬을 솔직하게 정리합니다.
#bioinformatics#career#skills#programming
생명과학2026년 2월 21일· 6 min read
액체 생검(Liquid Biopsy) — 혈액 기반 암 진단 바이오마커의 현재와 미래 (2026)
액체 생검이란? 혈액으로 암을 진단하는 ctDNA, CTC, 엑소좀 기반 바이오마커 기술의 원리, 임상 적용, FDA 승인 검사, 그리고 다중암 조기검진(MCED)의 최신 동향을 소개합니다.
#액체생검#ctDNA#암조기진단#바이오마커
생명과학2026년 2월 21일· 6 min read
AlphaFold3 단백질 구조 예측과 신약 개발 활용 — AI가 바꾸는 구조생물학
알파폴드3의 혁신적 단백질 구조 예측 기술과 신약 개발 적용 사례를 정리합니다. 기존 AlphaFold2와의 차이점, 분자 도킹, 약물 설계에서의 실전 활용법까지 소개합니다.
#AlphaFold3#단백질구조예측#신약개발#AI신약
생명과학2026년 2월 21일· 5 min read
scRNA-seq 단일세포 시퀀싱 분석 파이프라인 완벽 가이드 (2026)
Single cell RNA-seq 분석의 A to Z. 10x Genomics 기반 단일세포 시퀀싱 데이터의 전처리, 클러스터링, 세포 타입 어노테이션까지 분석 파이프라인을 단계별로 설명합니다.
#단일세포시퀀싱#scRNA-seq#바이오인포매틱스#Seurat
생명과학2026년 2월 21일· 6 min read
CRISPR-Cas9 유전자 편집 원리와 2026 최신 동향 — 유전자 가위의 모든 것
크리스퍼 원리부터 최신 유전자 가위 기술까지. CRISPR-Cas9의 작동 메커니즘, 베이스 에디팅, 프라임 에디팅 등 2026년 유전자 편집 최신 동향을 총정리합니다.
#CRISPR#유전자편집#유전자가위#베이스에디팅
생명과학2026년 2월 21일· 7 min read
2026 단백질체학(Proteomics) 연구 완벽 가이드 — 프로테오믹스 입문부터 실전까지
단백질체학이란 무엇인가? 프로테오믹스 입문자를 위한 핵심 개념, 질량분석 기반 워크플로우, 최신 연구 동향까지 2026년 기준으로 정리한 완벽 가이드입니다.
#프로테오믹스#단백질체학#질량분석#바이오인포매틱스
Clinical Research2026년 2월 20일· 8 min read
Clinical Proteomics Applications — How Protein Analysis Is Transforming Medicine
Explore clinical proteomics applications in diagnostics, drug development, and precision medicine. Learn how protein analysis is transforming patient care in 2026.
#clinical proteomics#precision medicine#diagnostics#biomarkers
Proteomics2026년 2월 20일· 8 min read
DIA-NN Proteomics Software Review — Features, Performance, and Tutorial
In-depth review of DIA-NN proteomics software. Learn about its features, performance benchmarks, library-free analysis, and how to use it for DIA mass spectrometry data.
#DIA-NN#proteomics software#DIA#mass spectrometry
Proteomics2026년 2월 20일· 8 min read
How to Use MaxQuant — A Step-by-Step Tutorial for Beginners
Complete MaxQuant tutorial for beginners. Learn how to set up, configure, and run MaxQuant for proteomics data analysis with step-by-step instructions and tips.
#MaxQuant#tutorial#proteomics#mass spectrometry
Clinical Research2026년 2월 20일· 8 min read
Biomarker Discovery Pipeline Explained — From Samples to Clinical Validation
Learn how biomarker discovery works from start to finish. This guide covers the complete pipeline from sample collection to clinical validation using proteomics and multi-omics.
#biomarker discovery#clinical proteomics#pipeline#diagnostics
Proteomics2026년 2월 20일· 7 min read
Single-Cell Proteomics Guide — Technologies, Methods, and Applications
Complete guide to single-cell proteomics in 2026. Learn about SCoPE-MS, plexDIA, mass cytometry, and how single-cell protein analysis is transforming biology.
#single-cell proteomics#SCoPE-MS#mass spectrometry#cell heterogeneity
Computational Biology2026년 2월 20일· 8 min read
Machine Learning in Drug Discovery — How AI Is Transforming Pharma in 2026
Explore how machine learning is revolutionizing drug discovery. From target identification to clinical trials, learn how AI accelerates pharmaceutical development in 2026.
#machine learning#drug discovery#AI#pharmaceutical
Systems Biology2026년 2월 20일· 7 min read
Proteomics vs Genomics — Key Differences You Need to Know
Understand the key differences between proteomics and genomics. Learn how these complementary fields study genes vs proteins and why both matter for modern biology.
#proteomics#genomics#comparison#omics
Proteomics2026년 2월 20일· 8 min read
How to Analyze Mass Spectrometry Data — A Complete Beginner's Guide
Step-by-step guide to analyzing mass spectrometry data for proteomics. Learn about raw data processing, database searching, quantification, and statistical analysis.
#mass spectrometry#data analysis#proteomics#MaxQuant
Bioinformatics2026년 2월 20일· 7 min read
Best Bioinformatics Tools in 2026 — Essential Software for Researchers
Discover the best bioinformatics tools in 2026 for genomics, proteomics, and systems biology. From Python libraries to cloud platforms, find the right tools for your research.
#bioinformatics tools#computational biology#software#data analysis
Proteomics2026년 2월 20일· 9 min read
What Is Proteomics? A Simple Explanation for Beginners
Learn what proteomics is in simple terms. Discover how scientists study proteins, why it matters for medicine, and how mass spectrometry powers modern proteomics research.
#proteomics#mass spectrometry#protein analysis#beginners guide
Bioinformatics2026년 2월 18일· 11 min read
Bioconductor 패키지 고르는 현실적인 기준
Bioconductor에 패키지가 2000개 넘는데, 도대체 뭘 써야 하나? 직접 써보면서 정리한 현실적인 패키지 선택 기준을 공유합니다.
#Bioconductor#R packages#bioinformatics#RNA-seq analysis
바이오인포매틱스2026년 2월 16일· 6 min read
바이오인포매틱스 입문자를 위한 R vs Python 선택 가이드 (2026년 기준)
바이오인포매틱스 입문자를 위한 R vs Python 선택 가이드. 2026년 기준 트렌드와 실전 학습 로드맵을 경험 기반으로 정리했습니다.
#AI/ML#프로그래밍#bioinformatics#R
구조생물학2026년 2월 16일· 6 min read
AlphaFold3 이후 구조생물학의 변화와 시스템생물학 연계
AlphaFold3 이후 구조생물학이 시스템생물학과 어떻게 연계되고 있는지 실전 경험을 바탕으로 살펴봅니다. 활용 워크플로우, 주요 도구, 한계점을 다룹니다.
#구조생물학#시스템생물학#AlphaFold#protein structure prediction
프로테오믹스2026년 2월 16일· 6 min read
프로테오믹스 데이터 전처리: 결측값 처리의 모든 것
질량분석 기반 프로테오믹스 데이터의 결측값 처리 방법을 총정리합니다. MNAR vs MAR 구분, 대체 방법 비교, 실전 워크플로우와 주의사항을 다룹니다.
#데이터분석#프로테오믹스#systems biology#bioinformatics
멀티오믹스2026년 2월 16일· 6 min read
멀티오믹스 통합 분석으로 바이오마커 발굴이 달라지는 이유
멀티오믹스 통합 분석이 바이오마커 발굴 과정을 어떻게 변화시키는지 실전 경험을 바탕으로 설명합니다. MOFA+, DIABLO 등 주요 도구와 통합 전략을 소개합니다.
#멀티오믹스#바이오마커#multi-omics#data integration
전사체학2026년 2월 16일· 6 min read
단일세포 RNA-seq 분석 실전 가이드: Seurat vs Scanpy, 어떤 걸 써야 할까?
단일세포 RNA-seq 분석 도구 Seurat과 Scanpy를 실전 경험을 바탕으로 비교합니다. 각 도구의 장단점, 선택 기준, 그리고 분석 시 주의할 점을 정리했습니다.
#단일세포분석#바이오인포매틱스#RNA-seq#single-cell
Bioinformatics2026년 2월 15일· 11 min read
처음 R로 RNA-seq 분석했을 때 삽질 기록
RNA-seq 분석을 R로 처음 시도하면서 겪었던 시행착오와 삽질의 기록. FASTQ부터 DESeq2까지, 아무도 안 알려주는 실전 팁을 정리했습니다.
#RNA-seq analysis#bioinformatics#DESeq2#R
바이오인포매틱스2026년 2월 14일· 11 min read
Top 10 Bioinformatics Databases Every Researcher Should Know
Why Bioinformatics Databases Matter Bioinformatics databases are the backbone of modern biological research. They store, organize, and provide access to the vast more
#bioinformatics#R#Python#data analysis
AI/ML2026년 2월 11일· 8 min read
Machine Learning in Systems Biology: Methods, Applications, and Best Practices
The Intersection of Machine Learning and Systems Biology Systems biology aims to understand biological systems as integrated wholes. Machine learning provides the more
#machine learning#AI#systems biology#deep learning
프로테오믹스2026년 2월 8일· 6 min read
DIA vs DDA in Proteomics: A Comprehensive Comparison
Understanding Data Acquisition in Mass Spectrometry In bottom-up proteomics, peptides eluting from a liquid chromatography column enter the mass spectrometer, which must more
#proteomics#mass spectrometry#protein analysis#bioinformatics
AI/ML2026년 2월 5일· 8 min read
AI-Powered Biomarker Discovery: From Data to Clinical Application
The Biomarker Discovery Challenge Biomarkers — measurable indicators of biological states or conditions — are fundamental to modern medicine. They guide diagnosis, more
#machine learning#AI#systems biology#deep learning
유전체학2026년 2월 2일· 5 min read
Genomic Data Analysis in R: A Beginner’s Guide
Why R for Genomic Data Analysis? R has established itself as the dominant programming language for genomic data analysis. The Bioconductor project more
#genomics#R programming#bioinformatics#data analysis
네트워크 생물학2026년 1월 30일· 8 min read
Network Biology: Understanding Protein-Protein Interactions
Introduction to Network Biology Biological systems function through intricate networks of molecular interactions. Proteins rarely act alone — they form complexes, signal more
#network biology#protein-protein interaction#PPI#systems biology
프로테오믹스2026년 1월 26일· 7 min read
Introduction to Proteomics: From Mass Spectrometry to Data Analysis
What is Proteomics? Proteomics is the large-scale study of proteins — their structures, functions, interactions, and modifications. While the genome provides the more
#proteomics#mass spectrometry#protein analysis#bioinformatics
AI/신약개발2026년 1월 22일· 7 min read
How AI is Revolutionizing Drug Discovery
The Drug Discovery Crisis Developing a new drug takes an average of 10-15 years and costs over $2.6 billion. The success rate more
#AI#drug discovery#machine learning#deep learning
AI/신약개발2026년 1월 20일· 6 min read
약물 재창출(Drug Repurposing)에서 AI가 하는 일
AI 기반 약물 재창출의 주요 접근법과 성공 사례. 유전자 발현 매칭부터 지식 그래프까지 정리했다.
#AI#drug discovery#machine learning#deep learning
프로테오믹스2026년 1월 18일· 7 min read
Multi-Omics Data Integration: A Practical Guide
Why Multi-Omics Integration Matters Modern biological research generates data across multiple molecular layers — genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, and epigenomics. Each omics more
#proteomics#mass spectrometry#protein analysis#bioinformatics
합성생물학2026년 1월 15일· 6 min read
합성생물학과 시스템 생물학의 만남: 생명을 설계하다
합성생물학과 시스템 생물학이 만나는 지점. 유전자 회로 설계부터 DBTL 사이클까지 정리했다.
#시스템생물학#systems biology#computational modeling#biological networks
시스템 생물학2026년 1월 15일· 7 min read
What is Systems Biology? A Comprehensive Introduction
What is Systems Biology? Systems biology is an interdisciplinary field that focuses on understanding biological systems as integrated and interacting networks of more
#systems biology#computational modeling#biological networks#holistic approach
마이크로바이옴2026년 1월 8일· 5 min read
장내 미생물 분석: 16S rRNA에서 메타게노믹스까지
장내 미생물 분석의 두 가지 접근법, 16S rRNA와 샷건 메타게노믹스를 비교하고 주요 분석 도구를 정리했다.
#microbiome#16S rRNA#metagenomics#gut microbiota
후성유전체학2025년 12월 28일· 5 min read
후성유전체학(Epigenomics) 분석 가이드: DNA 서열 너머의 정보
DNA 메틸화, 히스톤 변형, 크로마틴 접근성까지. 후성유전체학의 주요 기술과 분석 도구를 정리했다.
#epigenomics#DNA methylation#histone modification#gene regulation
구조생물학2025년 12월 12일· 6 min read
AlphaFold 이후의 구조 생물학: 무엇이 달라졌나
AlphaFold가 구조 생물학에 가져온 변화와 남아있는 한계. AlphaFold3, ESMFold까지 최신 동향을 정리했다.
#AlphaFold#protein structure prediction#structural biology#deep learning
바이오마커2025년 11월 28일· 6 min read
바이오마커 발굴, 통계적으로 제대로 하려면
오믹스 데이터에서 바이오마커를 발굴할 때 빠지기 쉬운 통계적 함정과 올바른 접근법을 정리했다.
#biomarker#statistical analysis#clinical research#proteomics
공간 전사체학2025년 11월 22일· 5 min read
공간 전사체학(Spatial Transcriptomics) 입문: 세포의 위치가 말해주는 것
공간 전사체학의 주요 기술과 분석 방법. Visium, MERFISH부터 데이터 분석 도구까지 정리했다.
#spatial transcriptomics#tissue mapping#gene expression#single-cell
네트워크 약리학2025년 11월 10일· 5 min read
네트워크 약리학: 약물과 질병을 시스템 수준에서 연결하다
네트워크 약리학의 개념, 분석 방법, 데이터 소스를 정리했다. 약물-타겟-질병 관계를 시스템 수준에서 이해하는 접근법.
#시스템생물학#network pharmacology#drug-disease network#systems pharmacology
전사체학2025년 10월 25일· 5 min read
단일세포 RNA 시퀀싱(scRNA-seq) 분석, 처음부터 끝까지
단일세포 RNA 시퀀싱 분석의 전체 흐름. 플랫폼 선택부터 클러스터링, 세포 타입 annotation까지 정리했다.
#RNA-seq#single-cell#transcriptomics#scRNA-seq
바이오인포매틱스2025년 10월 18일· 6 min read
경로 분석(Pathway Analysis) 완전 가이드
ORA, GSEA, 토폴로지 기반 분석까지. 경로 분석의 방법론과 데이터베이스를 체계적으로 정리했다.
#pathway analysis#gene set enrichment#KEGG#GO analysis
유전체학2025년 10월 8일· 6 min read
Variant Calling 실전 가이드: WGS/WES 데이터에서 변이 찾기
WGS/WES 데이터에서 변이를 찾는 실전 워크플로우. GATK, DeepVariant, 필터링 전략까지 한 번에 정리했다.
#variant calling#WGS#WES#genomic analysis
AI/ML2025년 9월 22일· 6 min read
생물정보학에서 머신러닝, 어디까지 왔나
생물정보학에서 머신러닝의 현주소를 점검한다. 성공한 영역, 발전 중인 영역, 그리고 피해야 할 함정까지.
#machine learning#AI#systems biology#deep learning
바이오인포매틱스2025년 9월 15일· 5 min read
생물정보학 도구 비교: R vs Python, 뭘 배워야 할까
생물정보학에서 R과 Python 중 어떤 언어를 선택해야 할지. 분야별 추천과 실전 조언을 정리했다.
#bioinformatics#R#Python#data analysis
멀티오믹스2025년 9월 5일· 6 min read
멀티오믹스 통합 분석: 데이터를 합치면 보이는 것들
멀티오믹스 통합 분석의 개념, 주요 접근법, 실전 도구를 정리했다. 여러 오믹스 데이터를 합치면 왜 다른 결론이 나오는지 살펴본다.
#시스템생물학#multi-omics#data integration#systems biology
프로테오믹스2025년 8월 18일· 5 min read
질량분석 기반 단백질체학의 진화: DDA에서 DIA까지
질량분석 기반 단백질체학의 기술 발전 흐름. DDA에서 DIA로의 전환, 정량 전략, 최신 장비까지 정리했다.
#프로테오믹스#proteomics#mass spectrometry#protein analysis
임상 프로테오믹스2025년 8월 5일· 6 min read
임상 프로테오믹스: 실험실에서 병원까지 가는 길
임상 프로테오믹스의 현주소. 기술 발전, 적용 사례, 그리고 넘어야 할 도전 과제를 정리했다.
#clinical proteomics#biomarker#translational research#mass spectrometry
유전체학2025년 7월 30일· 6 min read
CRISPR 스크리닝과 시스템 생물학: 유전자 기능을 대규모로 해부하다
CRISPR 스크리닝의 원리, 분석 방법, 그리고 시스템 생물학에서의 활용. Perturb-seq까지 이어지는 대규모 유전자 기능 연구의 흐름을 정리했다.
#CRISPR#gene editing#functional genomics#systems biology
대사체학2025년 7월 12일· 5 min read
대사체학 입문: 작은 분자들이 말해주는 큰 이야기
대사체학의 기본 개념부터 분석 플랫폼, 데이터 처리까지. 멀티오믹스 시대에 대사체학이 왜 중요한지 정리했다.
#시스템생물학#metabolomics#small molecules#mass spectrometry
전사체학2025년 6월 28일· 5 min read
RNA-seq 분석 파이프라인, 2025년 기준 어떤 걸 써야 할까
2025년 기준 RNA-seq 분석 파이프라인 비교. STAR, Salmon, DESeq2 등 주요 도구의 특징과 추천 워크플로우를 정리했다.
#RNA-seq#single-cell#transcriptomics#scRNA-seq
네트워크 생물학2025년 6월 10일· 6 min read
단백질 상호작용 네트워크, 어디서부터 시작해야 할까
단백질 상호작용 네트워크의 기초부터 실전 분석까지. PPI 데이터베이스, 네트워크 지표, 시각화 도구를 정리했다.
#시스템생물학#network biology#protein-protein interaction#PPI
시스템 생물학2025년 6월 3일· 2 min read
Systems biology
Systems biology is the computational and mathematical analysis and modeling of complex biological systems. It is a biology-based interdisciplinary field of study that focuses on complex interactions w
#systems biology#computational modeling#biological networks#holistic approach